注册商标使用许可合同的被许可人中，独占使用许可合同的被许可人可以自行向法院提起诉讼，排他使用许可合同的被许可人在商标注册人不起诉的情况下，可以自己提起诉讼，普通使用许可合同的被许可人经过注册商标人的特别授权也可以单独提起诉讼。这种说法值得商榷。在独占使用许可合同的场合，商标注册人在双方约定的期间内，已经将商标权全部转让给被许可人，在合同约定的期间内，被许可人实际上已经取代了商标注册人的地位，因此独占使用许可合同的被许可人可以自行向法院提起诉讼。排他使用许可合同和普通使用许可合同的被许可人，他们却不能自行就商标侵权行为起诉。最高人民法院《关于适用<民事诉讼法>若干问题的意见》规定，必须共同进行诉讼的当事人没有参加诉讼的，法院应当依照民事诉讼法第119条的规定，通知其参加诉讼。应当追加的原告，已明确表示放弃实体权利的，可不予追加；既不愿意参加诉讼，又不放弃实体权利的，仍要追加其为共同原告，其不参加诉讼，不影响法院对案件的审理和依法做出判决。上述规定的旨意在于，必须充分注意并考虑到诉讼主体问题，绝不仅仅是一个诉权问题，更主要的还是一个实体上的请求权问题。所以法院在确定某一个案件究竟有哪些原告参加诉讼的原则时，不能单纯地考虑程序上的合理、可行等问题，还必须同时考虑到实体权利分享与实际落实等更为重要的问题，进而实现实体与程序两种权利的平衡与统一。由此不难得出结论；如果实体权利应当由共同原告享有，而应当作为共同原告的当事人又没有全部参加案件的诉讼，他们又没有明示放弃实体权利，这个时候法院就不能允许一部分人可以单独享有诉权，而必须规定他们只能共同行使诉权。否则一旦认定侵权成立，权利人有的参加了诉讼，有的没有参加诉讼，法院就很难合理分配侵权所获得的赔偿利益。结合上面的结论，这里进一步探讨以下问题，当商标权人与非独占实施许可的被许可人约定，遇到商标侵权的场合，商标权人不起诉，而是由被许可人或者以自己的名义起诉，或者以商标权人的名义起诉。后一种情况符合委托代理的条件，在这里，被许可人实际上只是以委托代理人的身份代表商标权人行使本属于商标权人的诉权和请求权，在理论上和法律上均无问题或者障碍。前一种情况，如果商标权人就被告的侵权行为明确表示放弃实体权利，又通过合同约定将自己作为商标权人的财产权益以信托方式授权给被许可人，如果授权明确的话，其授权有效。但是商标权人的人身权利的不能信托的，即便双方当事人通过合同已经进行了信托，则合同约定的这一条款无效。比如商标权人就被告的侵权行为主张赔礼道歉的请求，在被许可人以自己的名义起诉时，法院就不能支持。在这种场合，法院不能判决被告向被许可人赔礼道歉，因为属于商标权人的人身权不能通过合同方式转移，法院也不能判决被告向商标权人赔礼道歉，因为商标权人没有作为共同原告参与案件的诉讼，法院不能判令被告向案外的商标权人赔礼道歉。如果商标权人就被告的侵权行为未明确表示放弃实体权利，又与被许可人约定；授权被许可人以自己的名义起诉；如果起诉的内容仅涉及请求被告停止侵权行为，没有赔偿损失的内容，法院可以同意；如果起诉的内容涉及到赔偿侵权损失的内容，法院则应当追加商标权人作为共同原告参加诉讼，或者在判令被告停止侵权的同时，驳回被许可人要求赔偿侵权损失的诉讼请求。

共同被告与共同原告就像钱币的两个面。在讨论到商标侵权主体问题，很容易联系到共同被告的确立依据和原则等问题。在商标侵权行为的实践中；有印制侵权商标标识、侵犯服务商标专用权和制造、销售侵犯商标专用权商品等直接和典型的商标侵权行为，也有帮助、教唆商标侵权的间接和非典型的商标侵权行为，例如为商标侵权行为提供仓储、运输、邮寄、隐匿等便利条件的行为。若干个被告人在实施上述行为时，其侵权行为可能发生在同一法院管辖的地域，也可能不在同法院管辖的地域。如果在同一地域，涉及众多被告是否都要列为共同被告，如果在不同地域，是否就不用列为共同被告，这些问题在实践中，一直存在争议，审判实践中的做法也不统一。